De inheemse honingbij klinkt misschien als een verrassing, maar veel van de in Nederland rondvliegende honingbijen (Apis mellifera) zijn geen inheemse bijen maar zijn bijen die hier oorspronkelijk niet vandaan komen. 
De zwarte honingbij (Apis mellifera mellifera) is de enige honingbij die oorspronkelijk thuishoort in Nederland en België. Het leefgebied van de zwarte honingbij strekt zich uit van de Alpen tot aan de Oerol.

De zwarte honingbij komt op dit moment in Nederland nog maar op een paar plaatsen voor. Door de sterke hybridisering, waarbij zwarte honingbijen zich kruisen met honingbijen van andere rassen, neemt het aantal zwarte honingbijen sterk terug. Alleen op Texel zijn er nog originele zwarte honingbijen te vinden omdat het voor de overige bijen lastiger is naar het eiland te gaan. Ook op andere plekken in Nederland zijn imkers bezig de originele zwarte honingbij weer terug in het landschap te krijgen. Belangrijk hierbij is wel dat er zorggedragen wordt dat kruisen met andere bijenrassen vermeden wordt.